南京醫科大學第二附屬醫院(又名南京醫科大學第二臨床醫學院、江蘇省第二紅十字醫院、南京醫科大學附屬兒童醫院)，是南京醫科大學直屬臨床教學醫院，是衛生部全科醫師培訓基地、衛生部消化內鏡診療培訓基地、衛生部婦科四級腔鏡診療培訓基地以及國家藥物臨床試驗機構(12個專業)。醫院的前身是南京市第四醫院，1981年成為南京醫學院第二附屬醫院，南京醫學院附屬兒童醫院，后隨南京醫科大學的改名，改為南京醫科大學第二附屬醫院，2007年單設南京醫科大學第二臨床醫學院。2007年托管南京市第三醫院(原南京鐵路醫院)，成立南京醫科大學第二附屬醫院東院，2009年成為三級甲等綜合醫院。

醫院共占地37523.8平方米，建筑面積79245.6平方米，開放床位1150張，年門診量115萬人次，出院病人4.4萬人次。醫院職工人數1968人，其中衛技人員1718人，高級職稱304人，中級職稱543人，博士生導師5人，碩士生導師54人，教授9人，副教授49人;江蘇省“突貢”人才3人，“雙創”人才2名，特聘教授1人，特聘醫學專家1位，“333工程”技術帶頭人13人，“六大人才高峰”項目資助14人，“興衛工程”重點學科1項(共建)、領軍人才(創新團隊)3人、重點人才4人(2名共建)。

自2007年3月，托管南京市三院(南原京鐵路醫院)成立東院后，醫院擁有兩個院區。醫院先后將兒科、婦產科、腎臟內科、眼科等整建制搬遷至東院，本部重點發展消化科、普外科、全科醫學等，初步形成本部以“大專科、大綜合”、東院以“大?？?、小綜合”為特色的醫療格局，2009年7月，南京市衛生局將東院兒童醫學中心掛牌成為南醫大二附院兒童醫院。

醫院設有37個臨床科室，15個教研室，消化內科、兒科、腎臟內科、婦產科、老年醫學科、神經內科、內分泌科、普外科、腫瘤科為江蘇省級臨床重點?？?。近五年，醫院主要業務指標持續保持30%的增長，醫院總收入由2008年3.62億元增加至2012年9.58億元;業務收入由3.24億元增至9.08億元;年門診量由58.5萬人次增至115萬人次;出院病人由2.12萬人次增至4.36萬人次;平均住院天數由12.9天降至10.8天。國家自然科學基金項目由零突破至14項，SCI論文由幾篇到80余篇。醫院有醫技科室20余個，其中放射科、物理診斷科、放療科、檢驗科、病理科人才濟濟、設施齊全，擁有一批先進的醫療儀器設備，如核磁共振、64排CT、科研型螺旋CT、直線加速器、癲癇刀、激光碎石機、DSA、ECT、PACS系統、彩色超聲儀、彩色經顱多普勒血流儀、24小時動態心電圖、自動十二導心電圖機、全自動生化分析儀、全自動電化學免疫發光儀、腫瘤超聲聚焦刀、熱療儀等。可開展腫瘤的常規放射治療、介入治療、立體定向適形放療(X-刀)，能夠滿足全身各個器官的診斷，開展各種類型的化驗診斷。

醫院堅持“要讓病人滿意，先讓職工滿意;態度決定一切，細節決定成敗”的管理理念;堅持“服務病人、滿意病人、感動病人”的服務理念;堅持“2007-2015三個三年”的醫院發展戰略，醫院正在積極建設一幢約5萬平方米的醫學綜合樓，全面提升醫、教、研各方面水平，努力將醫院建成省屬大型教學型綜合性醫院。

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